Kolejnym zastosowaniem kamer termowizyjnych jest monitorowanie operacji napełniania pojemników. Chociaż rzadko jest to problem związany z bezpieczeństwem produktu, ma on wpływ na wydajność i zgodność z przepisami. Różne obszary na butelce mogą być zdefiniowane i wykorzystane do uruchomienia alarmu i usunięcia butelek, które są nadmiernie lub niedostatecznie napełnione. Kamery termowizyjne są lepszą alternatywą dla kamer światła widzialnego, gdy butelka lub słoik są wykonane z ciemnego szkła lub plastiku.

Kamery termowizyjne same w sobie oferują użytkownikowi różne tryby pracy, które wspomagają prawidłowy pomiar temperatury w różnych warunkach. Dwie funkcje powszechnie spotykane w tych kamerach to punkt pomiarowy i  powierzchnia pomiarowa.

Oprogramowanie użytkowe dostępne obecnie dla kamer termowizyjnych obejmuje szeroką gamę funkcji, które wspierają zautomatyzowane aplikacje przetwarzania żywności. Oprogramowanie to uzupełnia i współdziała z oprogramowaniem wbudowanym w kamery termowizyjne. Narzędzia do obrazowania i biblioteki w tych pakietach są niezależne od sprzętu i języka, co ułatwia inżynierom przetwórstwa żywności szybkie wdrożenie systemów monitorowania i kontroli termicznej.

Punkt pomiarowy określa temperaturę w danym punkcie. Funkcja powierzchnia pomiarowa wyodrębnia wybrany obszar obiektu lub sceny i zazwyczaj podaje maksymalną, minimalną i średnią temperaturę wewnątrz tego obszaru. Zakres pomiaru temperatury jest zazwyczaj wybierany przez użytkownika. Jako dodatek do wyboru zakresu temperatury, większość kamer pozwala użytkownikowi na ustawienie skali kolorów lub skali szarości w celu optymalizacji obrazu z kamery.